Часть средств, выделенных ЕС, может быть не использованаГосконтроль в отчете "Освоение финансовой поддержки ЕС в 2004-2004 гг." делает вывод, что часть средств финансовой поддержки ЕС, предназначенной Литве, может остаться не использованной.
К концу 2007 г. было использовано 62 проц. средств из структурных фондов ЕС, а оставшаяся часть должна быть использована в этом году. Госконтроль указывает на существование риска того, что частьсредств не будет использована своевременно.
До установленного срока - конца 2010 г. также может остаться неиспользованной и часть средств Фонда сплочения, так как не подписаны все договора подряда, особенно в области охраны окружающей среды.
Кроме того, по данным Госконтроля, потребность в дополнительных средствах для осуществления финансируемых Фондом сплочения проектов в конце 2007 г. превышала 1 млрд. литов. Возросшая стоимость этих проектов должна финансироваться на средства государства, а в случае их недостатка, возможно, придется отказаться от некоторых компонентов проектов.
Существует риск, что не все предусмотренные проектами цели будут достигнуты. Министерство финансов сообщает, что в настоящее время ведутся переговоры с Еврокомиссией об отказе от некоторых проектов в области охраны окружающей среды, что на 335 млн. литов сократит потребность в дополнительных средств.
Госконтроль также отмечает, что часть средств финансовой поддержки ЕС переводится из бюджета Евросоюза непосредственно исполнителям или администраторам проектов и не распределяется через госбюджет.
Сбор данных о выделяемой Литве ЕС финансовой поддержке и ее использовании ведется в различных учреждениях и разных информационных источниках, однако обобщенная информация о всей получаемой из ЕС финансовой помощи и ее использовании в Литве не предоставляется.
Литве в период 2004-2006 гг. было выделено почти 6 млрд. литов из структурных фондов ЕС и более 3 млрд. литов - из гарантийного отдела Европейского фонда сельскохозяйственного ориентирования и гарантий.